Difference between revisions of "Team:ZJU-China/Newparts"

 
(20 intermediate revisions by 3 users not shown)
Line 3: Line 3:
 
<style>
 
<style>
 
     /* CLEAR DEFAULT SETTINGS **************************************************/
 
     /* CLEAR DEFAULT SETTINGS **************************************************/
     #sideMenu, #top_title, .patrollink, #firstHeading, #home_logo, #sideMenu { display:none; }
+
     #sideMenu,
     #content { padding-left:0px;width:100%; margin-top:10px; padding-top:0px;padding-bottom:0px;margin-bottom:-10px;margin-right:0px; margin-left:0px;border:none;}
+
    #top_title,
    body, html {background-image: url('https://static.igem.org/mediawiki/2020/9/9e/T--ZJU-China--wiki_back2.png'); width: 100%; height: 100%;}
+
    .patrollink,
    #top {display:none;}
+
    #firstHeading,
 +
    #home_logo,
 +
    #sideMenu {
 +
        display: none;
 +
     }
 
      
 
      
    #bodyContent a[href ^="https://"], .link-https { padding-right:0px;}
 
  
     #bodyContent p{font-size:large;}
+
    #content {
     #bodyContent h1,h2,h3,h4,h5,h6 {font-family:'Nunito', sans-serif;}
+
        padding-left: 0px;
     #bodyContent ul {margin: 0 0 0 0;list-style-image:url();}
+
        width: 100%;
</style>
+
        margin-top: 10px;
 +
        padding-top: 0px;
 +
        padding-bottom: 0px;
 +
        padding-right:0px;!important
 +
        margin-bottom: -10px;
 +
        margin-right: 0px;
 +
        margin-left: 0px;
 +
        border: none;
 +
        background-image: url('https://static.igem.org/mediawiki/2020/8/89/T--ZJU-China--wiki_index_backpage.png');
 +
    }
 +
 
 +
    body,
 +
    html {
 +
        background-image: url('https://static.igem.org/mediawiki/2020/8/89/T--ZJU-China--wiki_index_backpage.png');
 +
        width: 100%;
 +
        height: 100%;
 +
       
 +
    }
 +
 
 +
    #top {
 +
        display: none;
 +
    }
 +
 
 +
    #bodyContent a[href ^="https://"],
 +
    .link-https {
 +
        padding-right: 0px;
 +
    }
 +
 
 +
 
 +
 
 +
    #bodyContent a:visited {
 +
        color: black;
 +
    }
 +
 
 +
     #bodyContent p {
 +
        font-size: large;
 +
    }
 +
 
 +
     #bodyContent h1,
 +
    h2,
 +
    h3,
 +
    h4,
 +
    h5,
 +
    h6 {
 +
        font-family: 'Nunito', sans-serif;
 +
    }
 +
 
 +
     #bodyContent ul {
 +
        margin: 0 0 0 0;
 +
        list-style-image: url();
 +
    }
 +
 
 +
#preloader{
 +
       
 +
display: flex;
 +
        justify-content:center;
 +
        align-items: center;
 +
    }
 +
    #loader img{
 +
        width: auto;!important
 +
height: auto;!important
 +
max-width: 80%;
 +
max-height: 80%;
 +
    }
 +
 
 +
@media only screen and (max-width: 768px) {
 +
        .navigation ul {
 +
        display: none !important;
 +
    }
 +
 
 +
}
 +
 
 +
 
 +
#bodyContent .dropdown-list li a:hover {
 +
    background-color: rgb(199, 195, 195);
 +
}
 +
#bodyContent .dropdown-list li a:visited{
 +
    color:black;
 +
    }
 +
#bodyContent .dropdown-list li a:hover{
 +
    color:#2989d8;
 +
}
 +
 
 +
#bodyContent .navigation ul li a:hover{
 +
    color:#ffffff;
 +
}
 +
 
 +
 
 +
 
 +
#globalWrapper {
 +
padding-bottom:0;
 +
}
 +
 
 +
 
 +
#swapper{
 +
        position: relative;
 +
        height: auto;
 +
       
 +
    }
 +
#footer{
 +
        position:absolute;
 +
        bottom:0;
 +
        height:40px;
 +
    }
 +
#mcontent{
 +
       
 +
        padding-bottom: 40px;
 +
    }
 +
 
 +
 
 +
 
 +
</style>
  
 
<head>
 
<head>
Line 21: Line 135:
 
     <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1, shrink-to-fit=no">
 
     <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1, shrink-to-fit=no">
  
     <title>Experiments</title>
+
     <title>New Parts</title>
  
 
     <!--=======================================
 
     <!--=======================================
Line 29: Line 143:
 
     <!-- Custom styles for this template -->
 
     <!-- Custom styles for this template -->
 
     <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/CSS&action=raw&ctype=text/css" />
 
     <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/CSS&action=raw&ctype=text/css" />
 
+
 
  
 
     <!-- <link href="assets/css/style.css" rel="stylesheet"> -->
 
     <!-- <link href="assets/css/style.css" rel="stylesheet"> -->
  
     <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/CSS/barcss/site&action=raw&ctype=text/css" />
+
     <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/CSS/barcss/site.css&action=raw&ctype=text/css" />
 
+
 
 
     <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/CSS/barcss/jquery&action=raw&ctype=text/css" />
 
     <link rel="stylesheet" type="text/css" href="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/CSS/barcss/jquery&action=raw&ctype=text/css" />
 
+
 
   
+
 
   
+
 
   
+
 
 
     <link rel="stylesheet" href="https://cdn.staticfile.org/font-awesome/4.7.0/css/font-awesome.css">
 
     <link rel="stylesheet" href="https://cdn.staticfile.org/font-awesome/4.7.0/css/font-awesome.css">
   
+
 
 
     <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/JS/barjs/jquery&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 
     <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/JS/barjs/jquery&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 
     <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/JS/barjs/code&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 
     <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/JS/barjs/code&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
Line 48: Line 162:
 
     <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/JS/barjs/main&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 
     <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/JS/barjs/main&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
  
   
+
 
   
+
 
  
  
Line 57: Line 171:
 
     <script src="https://oss.maxcdn.com/respond/1.4.2/respond.min.js"></script>
 
     <script src="https://oss.maxcdn.com/respond/1.4.2/respond.min.js"></script>
 
     <![endif]-->
 
     <![endif]-->
<style>
+
    <style>
p{
+
        p {
    font_size:40px;
+
            font_size: 40px;
}
+
        }
 
+
    </style>
</style>
+
  
  
Line 68: Line 181:
 
</head>
 
</head>
  
<body style="background-image: url('https://static.igem.org/mediawiki/2020/9/9e/T--ZJU-China--wiki_back2.png');">
+
<body style="background-image: url('https://static.igem.org/mediawiki/2020/8/89/T--ZJU-China--wiki_index_backpage.png');">
  
<!-- Pre Loader Area start -->
+
    <!-- Pre Loader Area start -->
<div id="preloader">
+
<div id="preloader" style="text-align:center;margin: 0 auto;">
    <div class="loader"></div>
+
</div>
+
<!-- Pre Loader Area End -->
+
 
+
<div class="navigation">
+
+
    <ul> 
+
        <li> 
+
            <a href="#Cloning" style="background-color: #f6b37f;" class="nav-active rounded"><span>Overview</span></a> 
+
        </li> 
+
        <li> 
+
            <a href="#about"  style="background-color: #7ecef4;" class="rounded"><span>Improved T7 promoters</span></a> 
+
        </li> 
+
        <li> 
+
            <a href="#services" style="background-color: #f19ec2;" class="rounded"><span>Parts expressed by <i>E.coli</i> BL21 (DE3)</span></a>   
+
        </li> 
+
        <li> 
+
            <a href="#showcase" style="background-color:#eb6877;"class="rounded"><span>Parts expressed by <i>E.coli</i> SHuffle<sup>®</sup>T7 Express Cells</span></a>   
+
        </li>
+
         
+
 
        
 
        
 +
        <img  style="width: auto;height: auto;max-width: 30%;max-height: 30%;" src="https://static.igem.org/mediawiki/2020/6/6b/T--ZJU-China--wiki_loading.gif">
 
          
 
          
     </ul>   
+
     </div>
</div>  
+
 
 +
    <!-- Pre Loader Area End -->
 +
 
 +
    <div class="navigation">
 +
 +
        <ul>   
 +
            <li> 
 +
                <a href="#Cloning" style="background-color: #f6b37f;" class="nav-active rounded"><span>Overview</span></a> 
 +
            </li> 
 +
            <li> 
 +
                <a href="#about"  style="background-color: #7ecef4;" class="rounded"><span>Improved T7 Promoters</span></a> 
 +
            </li> 
 +
            <li> 
 +
                <a href="#services" style="background-color: #f19ec2;" class="rounded"><span><i>E.coli</i> BL21 (DE3)</span></a>   
 +
            </li> 
 +
            <li> 
 +
                <a href="#showcase" style="background-color:#eb6877;"class="rounded"><span><i>E.coli</i> SHuffle<sup>®</sup> T7 Express Cells</span></a>   
 +
            </li>
 +
             
 +
         
 +
           
 +
        </ul> 
 +
    </div>
 +
 
 
<!--Main Menu/ Mobile Menu Section-->
 
<!--Main Menu/ Mobile Menu Section-->
 
<section class="menu-section-area" >
 
<section class="menu-section-area" >
  
 
     <!-- Navigation -->
 
     <!-- Navigation -->
     <nav class="navbar navbar-expand-lg fixed-top d-none d-sm-none d-md-block d-lg-block d-xl-block" id="mainNav" style="background-image: url('https://static.igem.org/mediawiki/2020/b/b9/T--ZJU-China--wiki_navback2.png');" >
+
     <nav class="navbar navbar-expand-lg fixed-top d-none d-sm-none d-md-block d-lg-block d-xl-block" id="mainNav" style="background-color:white;" >
 
         <div class="container">
 
         <div class="container">
             <a class="navbar-brand" href="index.html" style="left:-10%;margin:-20px"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2020/7/7f/T--ZJU-China--temt.png" class="img-fluid" width="150px" ></a>
+
             <a class="navbar-brand" href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China" style="left:-10%;margin-top:-18px;margin-bottom:-26px;margin-left:-18px;margin-right:-18px;"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2020/d/dd/T--ZJU-China--wiki_logo_new.png" class="img-fluid" width="150px" ></a>
           
+
       
 
             <div class="collapse navbar-collapse" id="navbarResponsive" >
 
             <div class="collapse navbar-collapse" id="navbarResponsive" >
 
                 <ul class="navbar-nav text-capitalize ml-auto">
 
                 <ul class="navbar-nav text-capitalize ml-auto">
 
                     <li class="nav-item dropdown-box" style="background-color:pink;;opacity: 0.9;">
 
                     <li class="nav-item dropdown-box" style="background-color:pink;;opacity: 0.9;">
                         <a class="nav-link js-scroll-trigger" href="index.html">Home</a>
+
                         <a class="nav-link js-scroll-trigger" href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China">Home</a>
 
                        
 
                        
 
                     </li>
 
                     </li>
Line 113: Line 230:
 
                         <a class="nav-link" href="#">Team</a>
 
                         <a class="nav-link" href="#">Team</a>
 
                         <ul class="dropdown-list" >
 
                         <ul class="dropdown-list" >
                             <li><a href="team.html">Team Members</a></li>
+
                             <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Team">Members</a></li>
                             <li><a href="domain.html">Attributions</a></li>
+
                             <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Attributions">Attributions</a></li>
 +
                            <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Medals">Medals</a></li>
 
                              
 
                              
 
                            
 
                            
Line 122: Line 240:
 
                         <a class="nav-link" href="#">Project</a>
 
                         <a class="nav-link" href="#">Project</a>
 
                         <ul class="dropdown-list">
 
                         <ul class="dropdown-list">
                             <li><a href="domain.html">Description</a></li>
+
                             <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Description">Description</a></li>
                             <li><a href="background.html">Background</a></li>
+
                             <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Background">Background</a></li>
                             <li><a href="domain.html">Design</a></li>
+
                             <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Design">Design</a></li>
                             <li><a href="experiment.html">Experiments</a></li>
+
                             <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Magnetosome">Magnetosome</a></li>
                             <li><a href="hosting.html">Result</a></li>
+
                            <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Experiments">Experiments</a></li>
                             <li><a href="hosting.html">Demonstrate</a></li>
+
                             <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Results">Results</a></li>
 +
                             <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Future">Future</a></li>
 
                         </ul>
 
                         </ul>
 
                     </li>
 
                     </li>
 
                     <li class="nav-item dropdown-box" style="background-color:dodgerblue;opacity: 0.9;">
 
                     <li class="nav-item dropdown-box" style="background-color:dodgerblue;opacity: 0.9;">
                         <a class="nav-link" href="#">Modeling</a>
+
                         <a class="nav-link" href="#">Model</a>
 
                         <ul class="dropdown-list">
 
                         <ul class="dropdown-list">
                            <li><a href="services.html">Overview</a></li>
+
                            <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Model">Model</a></li>
                             <li><a href="services-classic.html">xxx Model</a></li>
+
                             <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Engineering">Engineering</a></li>
 +
                            <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Proof_Of_Concept">Proof of Concept</a></li>
 +
                           
 
                              
 
                              
 
                         </ul>
 
                         </ul>
Line 141: Line 262:
 
                         <a class="nav-link" href="#">Parts</a>
 
                         <a class="nav-link" href="#">Parts</a>
 
                         <ul class="dropdown-list">
 
                         <ul class="dropdown-list">
                             <li><a href="about.html">Measurement</a></li>
+
                             <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Contribution">Contribution</a></li>
                             <li><a href="pricing-table.html">Improvement</a></li>
+
                             <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Improve">Improve</a></li>
                             <li><a href="login.html">New Parts</a></li>
+
                             <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Newparts">New Parts</a></li>
 
                              
 
                              
 
                         </ul>
 
                         </ul>
Line 150: Line 271:
 
                         <a class="nav-link" href="#">Human</a>
 
                         <a class="nav-link" href="#">Human</a>
 
                         <ul class="dropdown-list">
 
                         <ul class="dropdown-list">
                             <li><a href="safety.html">Safety</a></li>
+
                             <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Human_Practices">Human Practices</a></li>
                             <li><a href="blog-classic.html">Human Practice</a></li>
+
                             <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Education">Education</a></li>
 +
                            <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Collaborations">Collaborations</a></li>
 +
                            <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Partnership">Partnership</a></li>
 +
                            <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Safety">Safety</a></li>
 
                              
 
                              
                        </ul>
+
                            <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Implementation">Implementation</a></li>
                    </li>
+
                             <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Entrepreneurship">Entrepreneurship</a></li>
                    <li class="nav-item dropdown-box" style="background-color:orchid;opacity: 0.9;">
+
                        <a class="nav-link" href="#">Application</a>
+
                        <ul class="dropdown-list">
+
                            <li><a href="blog-grid.html">Hardware</a></li>
+
                             <li><a href="blog-classic.html">Software</a></li>
+
 
                              
 
                              
 +
 +
                       
 
                         </ul>
 
                         </ul>
 
                     </li>
 
                     </li>
 +
                   
 
                    
 
                    
 
                 </ul>
 
                 </ul>
Line 172: Line 294:
 
     <!-- Mobile Menu Start -->
 
     <!-- Mobile Menu Start -->
 
     <nav class="mobile_menu hidden d-none">
 
     <nav class="mobile_menu hidden d-none">
         <a href="index.html"><img class="mobile-logo" src="https://static.igem.org/mediawiki/2020/7/7f/T--ZJU-China--temt.png" alt="Logo"></a>
+
         <a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China"><img class="mobile-logo" src="https://static.igem.org/mediawiki/2020/7/7f/T--ZJU-China--temt.png" alt="Logo"></a>
 
         <ul class="nav navbar-nav navbar-right menu">
 
         <ul class="nav navbar-nav navbar-right menu">
 
             <li class="dropdown active">
 
             <li class="dropdown active">
Line 181: Line 303:
 
                 <a>Team</a>
 
                 <a>Team</a>
 
                 <ul class="sub_menu">
 
                 <ul class="sub_menu">
                     <li><a href="team.html">Team Members</a></li>
+
                     <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Team">Members</a></li>
                     <li><a href="domain.html">Attributions</a></li>
+
                     <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Attributions">Attributions</a></li>
 +
                    <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Medals">Medals</a></li>
 +
                           
 
                 </ul>
 
                 </ul>
 
             </li>
 
             </li>
Line 188: Line 312:
 
                 <a>Project</a>
 
                 <a>Project</a>
 
                 <ul class="sub_menu">
 
                 <ul class="sub_menu">
                     <li><a href="domain.html">Description</a></li>
+
                     <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Description">Description</a></li>
                    <li><a href="background.html">Background</a></li>
+
                            <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Background">Background</a></li>
                    <li><a href="domain.html">Design</a></li>
+
                            <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Design">Design</a></li>
                    <li><a href="domain.html">Experiments</a></li>
+
                            <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Magnetosome">Magnetosome</a></li>
                    <li><a href="domain.html">Result</a></li>
+
                            <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Experiments">Experiments</a></li>
                    <li><a href="domain.html">Demonstrate</a></li>
+
                            <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Results">Results</a></li>
 +
                            <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Future">Future</a></li>
 
                 </ul>
 
                 </ul>
 
             </li>
 
             </li>
 
             <li class="dropdown">
 
             <li class="dropdown">
                 <a>Modeling</a>
+
                 <a>Model</a>
 
                 <ul class="sub_menu">
 
                 <ul class="sub_menu">
                    <li><a href="domain.html">Overview</a></li>
+
                    <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Model">Model</a></li>
                    <li><a href="domain.html">xxx Model</a></li>
+
                            <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Engineering">Engineering</a></li>
 +
                            <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Proof_Of_Concept">Proof of Concept</a></li>
 +
                                 
 
                 </ul>
 
                 </ul>
 
             </li>
 
             </li>
Line 206: Line 333:
 
                 <a>Parts</a>
 
                 <a>Parts</a>
 
                 <ul class="sub_menu">
 
                 <ul class="sub_menu">
                     <li><a href="domain.html">Measurement</a></li>
+
                     <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Contribution">Contribution</a></li>
                     <li><a href="domain.html">Improvement</a></li>
+
                     <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Improve">Improve</a></li>
                     <li><a href="domain.html">New Parts</a></li>
+
                     <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Newparts">New Parts</a></li>
 +
                           
 
                 </ul>
 
                 </ul>
 
             </li>
 
             </li>
Line 214: Line 342:
 
                 <a>Human</a>
 
                 <a>Human</a>
 
                 <ul class="sub_menu">
 
                 <ul class="sub_menu">
                     <li><a href="safety.html">Safety</a></li>
+
                     <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Human_Practices">Human Practices</a></li>
                     <li><a href="blog-classic.html">Human Practice</a></li>
+
                     <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Education">Education</a></li>
                </ul>
+
                    <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Collaborations">Collaborations</a></li>
            </li>
+
                    <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Partnership">Partnership</a></li>
            <li class="dropdown">
+
                    <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Safety">Safety</a></li>
                <a>Application</a>
+
                           
                <ul class="sub_menu">
+
                     <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Implementation">Implementation</a></li>
                     <li><a href="blog-grid.html">Hardware</a></li>
+
                     <li><a href="https://2020.igem.org/Team:ZJU-China/Entrepreneurship">Entrepreneurship</a></li>
                     <li><a href="blog-classic.html">Software</a></li>
+
                           
 
                 </ul>
 
                 </ul>
 
             </li>
 
             </li>
 +
           
 
              
 
              
 
         </ul>
 
         </ul>
Line 232: Line 361:
 
<!--Main Menu/ Mobile Menu Section-->
 
<!--Main Menu/ Mobile Menu Section-->
  
<div class="pagename">
+
<div id="swrapper">
    <h1>Newparts</h1>
+
<div id="mcontent" >
</div>
+
 
+
 
+
<div id="scrollable">
+
  
 +
    <div class="pagename">
 +
        <h1>Newparts</h1>
 +
    </div>
 
      
 
      
         <div class="pagestyle" style="background-image: url('https://static.igem.org/mediawiki/2020/c/cd/T--ZJU-China--wiki_navback.jpg');top:120px;">
+
   
            <div  class="section Cloning" id="Cloning">
+
    <div id="scrollable">
                <div class="container1">
+
   
 
+
          
                <h2>Overview</h2>
+
            <div class="pagestyle" style="background-image: url('https://static.igem.org/mediawiki/2020/c/cd/T--ZJU-China--wiki_navback.jpg');">
                <p>
+
                <div  class="section Cloning" id="Cloning">
                  This year, we designed 5 parts, and all of them had been submitted to the iGEM Registry following the BioBricks assembly standard.
+
                    <div class="container1">
                </p>                 
+
   
                <p>
+
                    <h2>Overview</h2>
                 
+
                    <p style="color:#808080;line-height:200%"><b>
                </p>
+
                      This year, we designed 5 parts, and all of them had been submitted to the iGEM Registry following the BioBricks assembly standard.
                <br>
+
                    </p>                 
                <p>
+
                    <p>
                  Here is a brief description of our parts. For more detailed information about our parts, we strongly recommend you visit the corresponding parts pages on the iGEM BioBricks Registry.
+
                     
                </p>
+
                    </p>
 
+
                    <br>
                <br>
+
                    <p style="color:#808080;line-height:200%"><b>
                <div class="imgbox">
+
                      Here is a brief description of our parts. For more detailed information about our parts, we strongly recommend you visit the corresponding parts pages on the iGEM BioBricks Registry.
                    <table style="width: auto;height: auto;max-width: 100%;max-height: 100%;margin-right:auto ;margin-left:auto;" class="pure-table pure-table-bordered">
+
                    </p>
                        <thead>
+
   
                            <tr>
+
                    <br>
                                <th>Name</th>
+
    <div class="imgbox">
                                <th>Type</th>
+
                          <h6 style="font-size:large;">Parts Table</h6>
                                <th>Description</th>
+
                                <th>Length(bp)</th>
+
                                <th>Designer</th>
+
                            </tr>
+
                        </thead>
+
 
                      
 
                      
                         <tbody>
+
                    </div>
                             <tr>
+
                    <div class="imgbox">
                                 <td>BBa_K3398000</td>
+
                         <table style="width: auto;height: auto;max-width: 100%;max-height: 100%;margin-right:auto ;margin-left:auto;" class="pure-table pure-table-bordered">
                                <td>T7</td>  
+
                             <thead>
                                <td>Modified T7 promoter 1</td>  
+
                                <tr>
                                 <td>64</td>  
+
                                    <th>Name</th>
                                 <td>Mingxiao Wei</td>  
+
                                    <th>Type</th>
                            </tr>
+
                                    <th>Description</th>
 +
                                    <th>Length(bp)</th>
 +
                                    <th>Designer</th>
 +
                                 </tr>
 +
                            </thead>
 +
                       
 +
                            <tbody>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td>BBa_K3398000</td>
 +
                                    <td>T7</td>  
 +
                                    <td>Modified T7 promoter 1</td>
 +
                                    <td>64</td>
 +
                                    <td>Mingxiao Wei</td>  
 +
                                 </tr>
 +
                       
 +
                                <tr>
 +
                                    <td>BBa_K3398001</td>
 +
                                    <td>T7</td>
 +
                                    <td>Modified T7 promoter 2</td>
 +
                                    <td>64</td>
 +
                                    <td>Mingxiao Wei</td>  
 +
                                 </tr>
 +
                       
 +
                                <tr>
 +
                                    <td>BBa_K3398002</td>
 +
                                    <td>T7</td>
 +
                                    <td>Modified T7 promoter 3</td>
 +
                                    <td>64</td>
 +
                                    <td>Mingxiao Wei</td>  
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td>BBa_K3398003</td>
 +
                                    <td>coding</td>
 +
                                    <td>mamC_ZZ fusion protein</td>
 +
                                    <td>771</td>
 +
                                    <td>Mingxiao Wei</td>
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td>BBa_K3398004</td>
 +
                                    <td>coding</td>
 +
                                    <td>mamC_ZZ fusion protein with GST tag</td>
 +
                                    <td>1464</td>
 +
                                    <td>Mingxiao Wei</td>
 +
                                </tr>
 +
                               
 +
                                <tr>
 +
                                    <td>BBa_K3398005</td>
 +
                                    <td>coding</td>
 +
                                    <td>scFv_Fc fusion protein</td>
 +
                                    <td>1497</td>
 +
                                    <td>Xiner Ying</td>
 +
                                </tr>
 +
                                <tr>
 +
                                    <td>BBa_K3398006</td>
 +
                                    <td>coding</td>
 +
                                    <td>scFv_Fc protein with FLAG tag</td>
 +
                                    <td>1524</td>
 +
                                    <td>Xiner Ying</td>
 +
                                </tr>
 +
                             
 +
                            </tbody>
 +
                        </table>
 +
                        </div>
 +
                        <br>
 +
                       
 
                      
 
                      
                            <tr>
+
   
                                <td>BBa_K3398001</td>
+
   
                                <td>T7</td>  
+
                    </div>
                                <td>Modified T7 promoter 2</td>  
+
                </div>
                                <td>64</td>
+
   
                                <td>Mingxiao Wei</td>  
+
               
                            </tr>
+
                <div  class="section about" id="about">
 +
                    <div class="container1">
 
                      
 
                      
                             <tr>
+
                             <h2>Improved T7 Promoters</h2>
                                <td>BBa_K3398002</td>
+
                             <p>
                                <td>T7</td>
+
                              <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3398000" target="_blank" style="color:#0a8aff;">BBa_K3398000</a>, <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3398001" target="_blank" style="color:#0a8aff;">BBa_K3398001</a>, <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3398002" target="_blank" style="color:#0a8aff;">BBa_K3398002</a>
                                <td>Modified T7 promoter 3</td>
+
                             </p>
                                <td>64</td>
+
   
                                <td>Mingxiao Wei</td>  
+
                             <br>
                             </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>BBa_K3398003</td>
+
                                <td>coding</td>
+
                                <td>mamC_ZZ fusion protein</td>
+
                                <td>771</td>  
+
                                <td>Mingxiao Wei</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>BBa_K3398004</td>
+
                                <td>coding</td>  
+
                                <td>mamC_ZZ fusion protein with GST tag</td>
+
                                <td>1464</td>
+
                                <td>Mingxiao Wei</td>  
+
                            </tr>
+
                              
+
                            <tr>
+
                                <td>BBa_K3398005</td>
+
                                <td>coding</td>
+
                                <td>scFv_Fc fusion protein</td>
+
                                <td>1497</td>
+
                                <td>Xiner Ying</td>
+
                             </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>BBa_K3398006</td>
+
                                <td>coding</td>
+
                                <td>scFv_Fc protein with FLAG tag</td>
+
                                <td>1524</td>
+
                                <td>Xiner Ying</td>
+
                            </tr>
+
 
                            
 
                            
                        </tbody>
+
                           
                    </table>
+
                            <p>
                    </div>
+
                                As a widely used promoter for expression of heterogenous protein in some <i>E.coli</i> strains such as BL21 (DE3) for its high efficiency, we improved T7 promoter by introducing some point mutations distributing in the range from +25 to +31 of the T7 promoter sequence. We chose EGFP as a reporter to test the function of our modified T7 promoters.
 +
                            </p>
 +
                           
 
                  
 
                  
 
+
                    </div>
 
+
 
                 </div>
 
                 </div>
            </div>
+
                <div  class="section services" id="services">
 
+
                    <div class="container1">
           
+
                         <h2 style="line-height:1.5;">Parts expressed by <i>E.coli</i> BL21 (DE3)</span></a>    </h2>
            <div  class="section about" id="about">
+
                        <br>
                <div class="container1">
+
               
+
                         <h2>Optimum concentration of IPTG for expressing</h2>
+
 
                         <p>
 
                         <p>
                             The transformed cells were grown until the OD<sub>600</sub> reached 0.6, at which time
+
                             <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3398003" target="_blank" style="color:#0a8aff;">BBa_K3398003</a>, <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3398004" target="_blank" style="color:#0a8aff;">BBa_K3398004</a>
                            protein expression was induced by a gradient from 0 to 2mM of IPTG. The cells
+
                            were then incubated at 30°C for an additional 24 h.
+
 
                         </p>
 
                         </p>
 
 
                         <br>
 
                         <br>
                         <br>
+
                         <p>
 
+
                            These parts are coding sequences of mamC and ZZ fusion protein. And for separation from other proteins at the purification step, we introduced a GST tag at the N-terminus and a thrombin site between the fusion protein and tag for cleavage after purification. To maximize the expression of a functional protein, they were subcloned into gene expression vector pGEX-2TK and transformed into <i>E.coli</i> BL21 (DE3) to express. These parts can also be expressed by magnetotactic bacteria such as MSR-1 to produce magnetosomes modified with ZZ protein on the surface as a self-assembly platform for polymer varied antibodies.
                        <h2>Optimum induction time for expressing</h2>
+
                        </p>
 
                          
 
                          
 +
                       
 +
                    </div>
 +
                </div>
 +
               
 +
                <div class="section showcase" id="showcase">
 +
                    <div class="container1">
 +
                        <h2 style="line-height:1.5;">Parts expressed by <i>E.coli</i> SHuffle<sup>®</sup> T7 Express Cells</h2>
 
                         <p>
 
                         <p>
                            The transformed cells were grown until the OD<sub>600</sub> reached 0.6, at which time
+
                          <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3398005"target="_blank" style="color:#0a8aff;">BBa_K3398005</a>, <a href="http://parts.igem.org/Part:BBa_K3398006"target="_blank" style="color:#0a8aff;">BBa_K3398006</a>
                            protein expression was induced by 2mM IPTG. The cells were then incubated at
+
                            30°C for a gradient from 0 to 24 h. For negative control, none inducer was
+
                            introduced.
+
 
                         </p>
 
                         </p>
 
                          
 
                          
           
+
                        <br>
                </div>
+
                        <p>
            </div>
+
                            These parts are coding sequences of scFv and Fc proteins. And for separation from other proteins at the purification step, we introduced a 10× histidine tag at the N-terminus which was followed by an enterokinase cleavage site for cleavage after purification. To maximize the expression of a functional protein, they were subcloned into gene expression vector pET19b and transformed into <i>E.coli</i> BL21 (DE3) to express. As the redox potential in the cytoplasm of general <i>E.coli</i> such as BL21 is too high, the disulfide bond in scFv will be reduced into thiol, which may not express the functional fusion proteins. So we chose <i>E.coli</i> SHuffle<sup>®</sup> with a reduced cytoplasmic environment as the chassis organism to express scFv-Fc fusion protein. The part of scFv-Fc is ideal molecule which can bind HER2 cells strongly and specifically, by adding report genes at either C- or the N-terminus, they can be used for the detection of HER2 cells.
            <div  class="section services" id="services">
+
                        </p>
                <div class="container1">
+
                        <br>
                    <h2 style="line-height:1.5;">Sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE)</h2>
+
                        <br>
                    <br>
+
                        <br>
                    <br>
+
                         <br>
                    <p>
+
                         <br>             
                        The cell lysate or purified protein was mixed 1:1 (v:v) with 2× loading buffer
+
   
                        (TIANGEN,Beijing,CN), heated for 5 min at 95°C and subjected to SDS–PAGE (5%
+
   
                        stacking gel, 8% separating gel). Gels were run at 110V for 15min and then at 160V
+
                          
                        for ~50 min in running buffer.
+
                     </div>  
                    </p>
+
                    <h2>Coomassie staining</h2>
+
                    <p>
+
                        Following SDS–PAGE, gels was stained with Coomassie brilliant blue (0.1% Coomassie
+
                        brilliant blue R-250, 25% isopropanol, 10% acetic acid) for 2 h at room temperature.
+
                        Destain in destaining buffer (5% ethanol, 10% acetic acid) overnight.
+
                    </p>
+
                    <h2>Western-blotting of proteins</h2>
+
                    <p>
+
                        Following SDS–PAGE, samples were transferred to nitrocellulose membrane (Merck) by
+
                        semi-dry transfer (Bio-Rad). Membranes were blocked 1 h at room temperature in 5%
+
                        (w/v) nonfat milk in TBST, probed with a rabbit anti-FLAG antibody (Abcam) overnight
+
                        at 4°C, washed with TBST, probed with a goat anti-rabbit HRP-conjugated antibody
+
                        (Sangon) for 1 h at room temperature, washed with TBST, and subsequently imaged using
+
                        ChemiDoc (Bio-Rad).Particularly, the blocked membranes were directly probed with a rabbit
+
                        anti-mouse HRP-conjugated antibody (Sangon) as the ZZ region could bind to the secondary antibody.
+
                    </p>
+
                    <h2>Co-immunoprecipitation</h2>
+
                    <p>
+
                         The supernatant of cell lysate of mamC-ZZ or purified mamC-ZZ was incubated with
+
                         purified FLAG-tagged scFv-Fc overnight at 4°C. Afterwards, the mixture was incubated
+
                        with anti-FLAG resin (GenScript, Nanjing, CN) for 1 h. The FLAG-tagged proteins scFv-Fc
+
                        and the interacted mamC-ZZ from the lysate were then immobilized on the resin, whereas
+
                         the unbound proteins were washed away with TBS. Subsequently, the protein–protein complex
+
                        was eluted with acid elution buffer. The elution was then digested by thrombin to cut off
+
                        GST region. The product was then analyzed by SDS-PAGE and western blotting. For negative
+
                        control, only purified scFv-Fc was used as input.
+
                     </p>
+
 
                 </div>
 
                 </div>
             </div>
+
               
 +
               
 +
                                       
 +
             </div>  
 
              
 
              
            <div class="section showcase" id="showcase">
+
    </div>
                <div class="container1">
+
</div>
                    <h2>Cell culture</h2>
+
                    <p>
+
                        MDA-MB-453, MDA-MB-231, MCF-7, and MDA-MB-468 cells were cultured in
+
                        high glucose Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM, Gibco) supplemented
+
                        with 10% fetal bovine serum (FBS, Gibco) in a humidified atmosphere with
+
                        5% CO2 at 37°C. All cells were passaged at 80% confluency.</p>
+
                        <br><br><br>
+
                    <h2 style="line-height:1.5;">Targeted cell uptake evaluation of scFv-Fc using flow cytometry</h2>
+
                    <br>
+
                    <br>
+
                    <p>
+
                        MDA-MB-453, MDA-MB-231, MCF-7, and MDA-MB-468 cells at 90% confluence were
+
                        collected, respectively, and seeded in a six-well plate. After overnight incubation,
+
                        the media were replaced with the fresh media containing 30 μg/mL of scFv-Fc and further
+
                        incubated for 1, 3, and 6 h. The cells were then collected by centrifugation after treatment
+
                        using 0.5% trypsin-EDTA and washed thrice with PBS. In the end, the cells were resuspended in
+
                        500 μL PBS, and the Alexa Fluor<sup>®</sup> 488 fluorescence of the cells was immediately analyzed using
+
                        a flow cytometer (CytoFLEX, Beckman Coulter Inc., USA).
+
                    </p>
+
                    <h2>Culture of Magnetotactic bacteria</h2>
+
                    <p>
+
                        Magnetotacitc bacteria is a general term refers to a group of species. Here, we choose <i>Magnetospirillum gryphiswaldense</i>
+
                        strain MSR-1 (BCRC17316) as our target. MSR-1 was purchased from Beaver County Rehabilitation
+
                        Center(Taiwan, China).
+
                    </p>
+
                    <p>
+
                        The culture medium(BCRC medium no.611) of M. Gryphiswaldense MSR-1 is prepared as follows.
+
                    </p>
+
                    <br>
+
                    <br>
+
  
                    <div class="imgbox">
+
<div class="footer" style="background-image: url('https://static.igem.org/mediawiki/2020/7/7f/T--ZJU-China--wiki_index_foot.png');background-size:100% 100%;">
                    <table class="pure-table pure-table-bordered">
+
    <div style="display:inline-block;height:180px;margin-left:25%;padding-top:130px;text-align:left;">
                        <thead>
+
        <a href="http://www.zju.edu.cn/" target="_blank" style="color:red;opacity:0;font-size:15px;z-index: 99999;width:20%">aannnaaaaannnnnnnnnnnnn</a>
                            <tr>
+
       
                                <th colspan="2">Magntospirillum medium</th>
+
    </div>
                            </tr>
+
    <div style="display:inline-block;height:180px;margin-left:15%;margin-right:10%;padding-top:130px;text-align:center;">
                        </thead>
+
        <a href="mailto:liangqiyu22@zju.edu.cn" target="_blank" style="color:red;opacity:0;font-size:15px;z-index: 99999;width:20%">aannnnnnnnn</a>
                   
+
       
                        <tbody>
+
    </div>
                            <tr>
+
   
                                <td>KH<sub>2</sub>PO<sub>4</sub></td>
+
   
                                <td>0.68g</td>
+
     
                            </tr>
+
</div>
                   
+
                            <tr>
+
                                <td>Na-thioglycolate</td>
+
                                <td>0.05g</td>
+
                            </tr>
+
                   
+
                            <tr>
+
                                <td>L(+)-Tartaric acid</td>
+
                                <td>0.37g</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>Succinic acid</td>
+
                                <td>0.37g</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>Trace elements solution</td>
+
                                <td>5ml</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>Resazurin</td>
+
                                <td>0.5mg</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>Distilled water</td>
+
                                <td>1000ml</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>NaNO<sub>3</sub></td>
+
                                <td>0.12g</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>Na-acetate</td>
+
                                <td>0.05g</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>Vitamin solution</td>
+
                                <td>10ml</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>Fe(III) quinate solution</td>
+
                                <td>Hyundai</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td colspan="2">
+
                                Dissolve components in the order given. Adjust pH to 6.75 with NaOH and
+
                                boil medium for 1 min. Purge medium with N<sub>2</sub> gas for 10 min. Under the same
+
                                atmosphere, anaerobically fill tubes to 1/3 of their volume and seal. Autoclave
+
                                at 121℃ for 15 min. Before inoculation, add.
+
                                </td>
+
                            </tr>
+
                        </tbody>
+
                    </table>
+
                    </div>
+
                   
+
                    <div class="imgbox">
+
                    <table class="pure-table pure-table-bordered" style="margin-left:0;margin-right:0;">
+
                        <thead>
+
                            <tr>
+
                                <th colspan="2">Trace elements solution</th>
+
                            </tr>
+
                        </thead>
+
                   
+
                        <tbody>
+
                            <tr>
+
                                <td>Nitrilotriacetic acid</td>
+
                                <td>1.5g</td>
+
                            </tr>
+
                   
+
                            <tr>
+
                                <td>MgSO<sub>4</sub>·7H<sub>2</sub>O</td>
+
                                <td>3g</td>
+
                            </tr>
+
                   
+
                            <tr>
+
                                <td>MnSO<sub>4</sub>·2H<sub>2</sub>O</td>
+
                                <td>0.5g</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>NaCl</td>
+
                                <td>1g</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>CaCl<sub>2</sub>·2H<sub>2</sub>O</td>
+
                                <td>0.1g</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>ZnSO<sub>4</sub>·7H<sub>2</sub>O</td>
+
                                <td>0.18g</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>CuSO<sub>4</sub>·5H<sub>2</sub>O</td>
+
                                <td>0.01g</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>Kal(SO<sub>4</sub>)2·12H<sub>2</sub>O</td>
+
                                <td>0.02g</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>H<sub>3</sub>3BO<sub>3</sub></td>
+
                                <td>0.05g</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>Na<sub>2</sub>MoO<sub>4</sub>·2H<sub>2</sub>O</td>
+
                                <td>0.01g</td>
+
                            </tr>
+
                            <tr>
+
                                <td>Distilled water</td>
+
                                <td>1000mL</td>
+
                            </tr>
+
  
                            <tr>
 
                                <td>FeSO<sub>4</sub>·7H<sub>2</sub>O</td>
 
                                <td>0.1g</td>
 
                            </tr>
 
                            <tr>
 
                                <td>CoSO<sub>4</sub>·7H<sub>2</sub>O</td>
 
                                <td>0.18g</td>
 
                            </tr>
 
                            <tr>
 
                                <td>NiCl<sub>2</sub>·6H<sub>2</sub>O</td>
 
                                <td>0.025g</td>
 
                            </tr>
 
                            <tr>
 
                                <td>Na<sub>2</sub>SeO<sub>3</sub>·5H<sub>2</sub>O</td>
 
                                <td>0.3mg</td>
 
                            </tr>
 
                            <tr>
 
                                <td>Na<sub>2</sub>WO<sub>4</sub>·2H<sub>2</sub>O</td>
 
                                <td>0.4mg</td>
 
                            </tr>
 
                            <tr>
 
                                <td colspan="2">
 
                                    Trace elements solution:First dissolve nitrilotriacetic acid adjust pH to
 
                                    6.5 with KOH, then add minerals. Final pH 7.0 (with KOH).
 
                                </td>
 
                            </tr>
 
                        </tbody>
 
                    </table>
 
                    </div>
 
                   
 
                   
 
                   
 
                    <div class="imgbox">
 
                    <table style="width: auto;height: auto;max-width: 100%;max-height: 100%;margin-right:auto ;margin-left:auto;" class="pure-table pure-table-bordered">
 
                        <thead>
 
                            <tr>
 
                                <th colspan="2">Ferric quinate solution, 0.01 M</th>
 
                            </tr>
 
                        </thead>
 
                   
 
                        <tbody>
 
                            <tr>
 
                                <td>FeCl<sub>3</sub>·6H<sub>2</sub>O</td>
 
                                <td>0.45g</td>
 
                            </tr>
 
                   
 
                            <tr>
 
                                <td>Quinic acid</td>
 
                                <td>0.19g</td>
 
                            </tr>
 
                   
 
                            <tr>
 
                                <td>Distilled water</td>
 
                                <td>100mL</td>
 
                            </tr>
 
                   
 
                            <tr>
 
                                <td colspan="2">
 
                                    Ferric quinate solution:Dissolve and autoclave at 121℃ for
 
                                    15 min.
 
                                </td>
 
                            </tr>
 
                        </tbody>
 
                    </table>
 
                    </div>
 
                    <br>
 
                    <br>
 
 
 
                    <p>
 
                        In the incubation period, aerobic environment is conducive to the growth of <i>M.gryphiswaldense</i> strain
 
                        MSR-1.However, MicroAeroPack or AnaeroPack is needed for fermentation period. The MicroAeroPack or
 
                        AnaeroPack was purchased from Mitsubishi Gas Chemical(Tokyo, Japan).
 
                    </p>
 
                </div>   
 
            </div>
 
            <div class="section our-team" id="our-team">
 
                <div class="container1">
 
                    <h2>Reference</h2>
 
                    <p>
 
                        [1]. Ahmadzadeh, M., Farshdari, F., Nematollahi, L. et al. Anti-HER2 scFv Expression in Escherichia coli SHuffle<sup>®</sup>T7 Express Cells: Effects on Solubility and Biological Activity. Mol Biotechnol 62, 18–30 (2020).
 
                    </p>
 
                    <br>
 
                    <br>
 
                </div> 
 
            </div>
 
           
 
           
 
                                   
 
        </div>
 
 
</div>
 
</div>
  
Line 650: Line 553:
  
  
 +
    <div class="top-arrow">
 +
        <a href="#" id="scroll" style="display:block ;"><img src="https://static.igem.org/mediawiki/2020/e/ea/T--ZJU-China--wiki_gifff.gif" style="position: absolute;bottom:10%;right:0%;width:140%;"></img></a>
 +
    </div>
  
  
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jsjquerymin&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jspropermin&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jsboot&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jsowl&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jseasing&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jstype&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jsq1&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jswow&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jsaos&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jsway&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
  
<div class="top-arrow">
+
     <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jscounter&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
     <a href="#" id="scroll" style="display:block ;"><i class="fa fa-angle-up" style="font-size:36px;color:pink"></i></a>
+
</div>
+
  
 +
    <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jsven&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
  
<script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jsjquerymin&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
    <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jssel&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
<script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jspropermin&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
<script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jsboot&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
<script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jsowl&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
<script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jseasing&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
<script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jstype&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
<script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jsq1&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
<script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jswow&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
<script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jsaos&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
<script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jsway&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
  
<script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jscounter&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
    <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jsmenu&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
  
<script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jsven&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
    <script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jscustom1&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
  
<script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jssel&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
    <script>
  
<script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jsmenu&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
        $document.ready(function () {
 +
            $("#HQ_page").attr('id', ");
 +
});
  
<script type="text/javascript" src="https://2020.igem.org/wiki/index.php?title=Template:ZJU-China/jscustom1&action=raw&ctype=text/javascript"></script>
+
    </script>
  
<script>
 
  
$document.ready(function(){
+
    <script>
$("#HQ_page").attr('id',");
+
        var typed = new Typed('#typed', {
});
+
            stringsElement: '#typed-strings',
 +
            typeSpeed: 100,
 +
            backSpeed: 100,
 +
            loop: true,
 +
            smartBackspace: true,
 +
        });
 +
    </script>
  
</script>
+
    <script>
 +
        function topMao(target) {
 +
            $('html, body').animate({ scrollTop: $(target).offset().top - 170 }, 500);//130为锚点到距顶部的距离,500为执行时间
 +
            return true;
 +
        }
 +
    </script>
  
 +
    <script>
 +
        var topBegin = $("#accordion").offset().top;  //获取导航栏(class='positionMiddleNav')离视口的高度
 +
        $(window).scroll(function () {  //scroll事件
 +
            var win_top = $(this).scrollTop(); //获取滚动条位置
 +
            var _top = $("#accordion").offset().top; //获取当前导航栏距视口高度
 +
            console.log(win_top, 'aa');
 +
            console.log(_top, 'cc');
 +
            if (win_top >= _top - 150) {
  
<script>
+
                $("#accordion").css({ position: "fixed", top: "10em" });
    var typed = new Typed('#typed', {
+
            }
        stringsElement: '#typed-strings',
+
            if (win_top < topBegin) { //因为导航栏距视口高度在定位发生后是变化的 ,
        typeSpeed: 100,
+
                //所以当导航栏回到原位置时保持先前状态需要将滚动条位置与最先前的导航栏位置进行对比
        backSpeed: 100,
+
                $("#accordion").css({ position: "absolute" });
        loop: true,
+
            }
        smartBackspace: true,
+
        })
    });
+
    </script>
</script>
+
  
<script>
+
     <script>
     function topMao(target){
+
    $('html, body').animate({scrollTop: $(target).offset().top - 170}, 500);//130为锚点到距顶部的距离,500为执行时间
+
    return true;
+
}
+
</script>
+
+
<script>
+
    var topBegin=$("#accordion").offset().top;  //获取导航栏(class='positionMiddleNav')离视口的高度
+
    $(window).scroll(function(){  //scroll事件
+
      var win_top=$(this).scrollTop(); //获取滚动条位置
+
      var _top=$("#accordion").offset().top; //获取当前导航栏距视口高度
+
       console.log(win_top , 'aa');
+
              console.log(_top , 'cc');
+
      if(win_top>=_top-150){
+
           
+
       $("#accordion").css({position: "fixed",top:"10em"}); 
+
      }
+
      if(win_top<topBegin){ //因为导航栏距视口高度在定位发生后是变化的 ,
+
      //所以当导航栏回到原位置时保持先前状态需要将滚动条位置与最先前的导航栏位置进行对比
+
       $("#accordion").css({position: "absolute"}); 
+
      }
+
    })
+
</script>
+
  
<script>
+
        function displaywindowsize() {
 +
            var w = document.documentElement.clientWidth;
 +
            var h = document.documentElement.clientHeight;
 +
            if (w < 1100 && w > 800) {
  
    function displaywindowsize(){
+
                $("#accordion").css({ left: "2%" });
        var w = document.documentElement.clientWidth;
+
                $("#accordion").css({ display: "block" });
        var h = document.documentElement.clientHeight;
+
            }
        if(w<1100&&w>800){
+
            else if (w < 800) {
         
+
                $("#accordion").css({ display: "none" });
             $("#accordion").css({left:"2%"});
+
             }
            $("#accordion").css({display:"block"});
+
            else {
 +
                $("#accordion").css({ left: "10%" });
 +
                $("#accordion").css({ display: "block" });
 +
            }
 
         }
 
         }
        else if(w<800){
 
            $("#accordion").css({display:"none"});
 
        }
 
        else{
 
            $("#accordion").css({left:"10%"});
 
            $("#accordion").css({display:"block"});
 
        }
 
    }
 
  
    window.addEventListener("resize",displaywindowsize);
+
        window.addEventListener("resize", displaywindowsize);
    displaywindowsize();
+
        displaywindowsize();
</script>
+
    </script>
  
  

Latest revision as of 04:00, 28 October 2020

New Parts

Newparts

Overview

This year, we designed 5 parts, and all of them had been submitted to the iGEM Registry following the BioBricks assembly standard.


Here is a brief description of our parts. For more detailed information about our parts, we strongly recommend you visit the corresponding parts pages on the iGEM BioBricks Registry.


Parts Table
Name Type Description Length(bp) Designer
BBa_K3398000 T7 Modified T7 promoter 1 64 Mingxiao Wei
BBa_K3398001 T7 Modified T7 promoter 2 64 Mingxiao Wei
BBa_K3398002 T7 Modified T7 promoter 3 64 Mingxiao Wei
BBa_K3398003 coding mamC_ZZ fusion protein 771 Mingxiao Wei
BBa_K3398004 coding mamC_ZZ fusion protein with GST tag 1464 Mingxiao Wei
BBa_K3398005 coding scFv_Fc fusion protein 1497 Xiner Ying
BBa_K3398006 coding scFv_Fc protein with FLAG tag 1524 Xiner Ying

Improved T7 Promoters

BBa_K3398000, BBa_K3398001, BBa_K3398002


As a widely used promoter for expression of heterogenous protein in some E.coli strains such as BL21 (DE3) for its high efficiency, we improved T7 promoter by introducing some point mutations distributing in the range from +25 to +31 of the T7 promoter sequence. We chose EGFP as a reporter to test the function of our modified T7 promoters.

Parts expressed by E.coli BL21 (DE3)


BBa_K3398003, BBa_K3398004


These parts are coding sequences of mamC and ZZ fusion protein. And for separation from other proteins at the purification step, we introduced a GST tag at the N-terminus and a thrombin site between the fusion protein and tag for cleavage after purification. To maximize the expression of a functional protein, they were subcloned into gene expression vector pGEX-2TK and transformed into E.coli BL21 (DE3) to express. These parts can also be expressed by magnetotactic bacteria such as MSR-1 to produce magnetosomes modified with ZZ protein on the surface as a self-assembly platform for polymer varied antibodies.

Parts expressed by E.coli SHuffle® T7 Express Cells

BBa_K3398005, BBa_K3398006


These parts are coding sequences of scFv and Fc proteins. And for separation from other proteins at the purification step, we introduced a 10× histidine tag at the N-terminus which was followed by an enterokinase cleavage site for cleavage after purification. To maximize the expression of a functional protein, they were subcloned into gene expression vector pET19b and transformed into E.coli BL21 (DE3) to express. As the redox potential in the cytoplasm of general E.coli such as BL21 is too high, the disulfide bond in scFv will be reduced into thiol, which may not express the functional fusion proteins. So we chose E.coli SHuffle® with a reduced cytoplasmic environment as the chassis organism to express scFv-Fc fusion protein. The part of scFv-Fc is ideal molecule which can bind HER2 cells strongly and specifically, by adding report genes at either C- or the N-terminus, they can be used for the detection of HER2 cells.